En 1032 el rey Bermudo
III de León permutó con los Condes de Piniolo y Aldonza, la mitad del
territorio.
En 1230 el rey Fernando III unió los reinos de León y Castilla, fue separado de
Asturias y agregado a tierras castellanas, en la merindad denominada "Asturias
de Santillana", aunque eclesiásticamente seguía dependiendo del Obispado de
Oviedo.
En 1340 el rey Alfonso XI le otorga el Fuero por el cual podían nombrar a sus
representantes, apareciendo el poder señorial de los Aguilar, que ostentaron el
Señorío de Peñamellera.
En 1514 formó parte junta con San Vicente de la Barquera, de una jurisdicción
independiente.
En 1749 fue agregado a la intendencia de Burgos y Bastón de Laredo.
En 1809 fue invadido por las tropas francesas del coronel Gauthier al romper la
vigilancia del río Deva, durante la Guerra de la Independencia.
En 1833 vuelve a depender de Asturias, merced a la nueva distribución
territorial de España.
En 1869 el pueblo de Abándames se convirtió en la capital de Peñamellera Baja,
tras el acuerdo de partición de las dos Peñamelleras.
En 1890 se traslado la capital del concejo a Panes.