Perteneció desde 1085 hasta 1834 a la Junta de Siete Villas, formando parte de la Merindad de Trasmiera, que eran paradójicamente Nueve, (Isal, Armuero, Castillo, Ajo, Bareyo, Güemes, Meruelo, Soano y Noja).
En 1644 el rey Felipe IV le concedió el título de villa a cambio de 500 ducados, lo que le permitió poder nombrar a sus propios alcaldes.

Su nombre proviene de "Noega" de origen protoindoeuropeo, que podría estar relacionado con el celta "Nouika" que significa "nueva", haciendo alusión a una fundación reciente, de manera similar a las muchas poblaciones que se llaman "Villanueva".

Sus principales atractivos turísticos son sus playas, muy concurridas en verano.

ESCENARIO

Se encuentra en la Plaza de la Villa.
Tiene una estructura semicircular con un graderío en forma de escalinata circular blanca y una cubierta a dos aguas que protege el escenario.
Es el lugar donde se celebran los conciertos veraniegos, actuaciones de danza, espectáculos infantiles y las verbenas de las fiestas patronales.

ESTANQUE

En un extremo de la Plaza de la Villa, está este estanque que cuenta con una pequeña isla de césped a la que se accede cruzando un puente de madera con barandillas cruzadas.

PALACIO DE ALBAICÍN

Es uno de los monumentos civiles e históricos más importantes del pueblo.
Fue construido en el S.XVI y reformado por completo en 1916 por el arquitecto cántabro Leonardo Rucabado, para la escritora Obdulia Bonifaz (esposa del Marqués de Albaicín).
Destaca el portalón de piedra de sillería con arco de medio punto, rematado por un escudo señorial y un copete de formas barrocas francesas.
Está custodiado por un muro curvo, flanqueado por cubos circulares rematados con bolas herrerianas.
Actualmente alberga la Casa de Cultura.

MONUMENTO ÁGORA

Es una obra abstracta diseñada por el pintor, escultor local Manuel Sáenz-Messia.
Está realizada en hormigón blanco y se fragmenta en varios bloques con marcadas líneas geométricas angulares.
Su hombre hace referencia al término griego "ágora" (lugar de reunión o discusión pública), simbolizando un espacio de encuentro y diálogo para los ciudadanos.

PLAYA DE TRENGANDÍN

Es una de las playas más largas de Cantabria, de 3.500 m. de longitud y 100 m. de anchura media.  También es conocida como la "Playa Grande" y "Playa de las Doradas", por la cantidad de doradas que se pesca en ella.
Su arena es fina y dorada y está bañada por aguas cristalinas y tranquilas.
Está rodeada por dunas y un ecosistema protegido, siendo el hogar de flora y fauna autóctonas, ideal para los amantes de la naturaleza.
Antiguamente se salía de noche, con luna creciente, a pescar morenas, y para llamarlas se les cantaba una canción sin palabras, primero susurrante y lánguida y después aguda, que parecía que viniese del fondo del mar o de ánimas perdidas en la noche.

PLAYA DE RIS

Tiene una extensión de 2.200 m. de longitud y 100 m. de anchura.  En marea baja permite disfrutar de más de 40.000 m² de arena fina dorada.
Su orientación hacia el norte propicia la práctica de Surf y del Kayak.
Al bajar la marea se crean pequeñas pozas donde los niños lo pasan en grande jugando con agua de mar pero sin peligro a las olas ni a la profundidad.

ISLA DE SAN PEDRUCO

Está situada enfrente de la playa de Ris.
Es un islote con mucha vegetación, que sirve de refugio para miles de gaviotas.
En la parte más alta se encuentra una ermita del S.XVI dedicada a San Pedro, pero ya antes había sido retiro espiritual de religiosos de la Edad Media.
Antiguamente se celebraba cada 1 de Agosto una concurrida romería marítima, para venerar la imagen de San Pedro.  Esta tradición se suspendió tras un trágico naufragio provocado por un golpe de mar repentino.
Cuando la marea está completamente baja, se forma un pasillo de arena que permite caminar hasta la isla.

MIRADOR MARISMA DE JOYEL

Junto a la carretera, tras aparcar el coche, nos encontramos con una pasarela de madera que nos conduce a una caseta de madera cubierta.
Funciona como un mirador y punto de observación ornitológica, que permite contemplar la fauna acuática del humedal de forma camuflada para no alterar ni asustar a las aves.

MARISMA DE JOYEL

Este espacio forma parte del "Parque Natural de las Marismas de Santoña, Victoria y Joyel", la zona húmeda más importante del norte peninsular, siendo una de las vías migratorias de aves más frecuentadas de Europa.
Es un ecosistema único donde coexisten agua dulce y salada, con motivo de las mareas.
Alberga una rica fauna, como ostras, mejillones, caracolillos, quisquillas, cangrejos, peces y aves.
Se han llegado a referenciar hasta 130 especies distintas.
La vegetación varía desde el carrizo en las zonas más húmedas hasta encinas en las áreas más elevadas.

OBSERVATORIO DE AVES

Tiene 7 m. de altura y ofrece una visión panorámica de 360º sobre el ecosistema protegido.
Está estratégicamente pensada para contemplar y fotografiar sin molestar a más de 50 especies de aves acuáticas y migratorias que habitan o descansan en la marisma Victoria.

MOLINO DE MAREAS DE SANTA OLAJA

Aunque pertenece al municipio de Arnuero, está completamente integrado en las rutas naturales de Noja.
Es un edificio del S.XIV recientemente restaurado, y es de los pocos molinos de mareas visitables que quedan en Europa.
Aprovecha la subida de la marea para llenar su presa de agua.  Al bajar la marea, las compuertas se abren y la fuerza del agua embalsada hace girar los rodetes de piedra para moler el grano.
En su época de máximo esplendor llegó a contar con 10 ruedas de molienda en funcionamiento continuo.
Actualmente es sede del Centro de Interpretación de la tradición molinera y el ecosistema de las marismas.

CAMINO DE SANTIAGO

Es una de las etapas del Camino de Santiago, denominado "Camino del Norte", que va por la costa Cantábrica, desde Hendaya hasta Santiago de Compostela.
La etapa 11 se inicia en Laredo y acaba en Noja, donde se inicia la etapa 12 hasta Santander.