En el S.X los musulmanes construyeron el castillo.
En 1119 fue reconquistado por el rey Alfonso I de Aragón.
El primer documento de la población data de 1131, donde Alfonso I dio a Sancho la abadía de Alfajarín.
En 1293 fue entregado el Señorío de Alfajarín a Pedro Cornel.
En 1437 la Baronía deja de ser propiedad de los Cornel, y el rey Alfonso V de Aragón, concedió a los habitantes franquicia perpetua a los derechos reales.
En el S.XV pasó a manos de Juan de Coloma, que era secretario de Fernando El Católico, y fue el encargado de firmas las Capitulaciones de Santa Fe, que era el trato entre Colón y la corona para su viaje a las Indias.
En 1496 pasó a manos de D. Ramón de Espés.
En 1879 desparece la Baronía con Doña María del Rosario Wall, realizando una permuta de tierras con el Ayuntamiento y perdonando las deudas a los vecinos del pueblo.